Pada awalanya SMKN 3 Baleendah adalah SPMA (Sekolah Pertanian
Menengah Atas) di bawah YAYASAN
PERTANIAN, siswanya pun hanya sedikit dan semua siswa bukan membayar tapi
dibayar oleh sekolah. Dengan berjalannya waktu, yayasan nya pun berganti
menjadi dibawah PEMERINTAH DEPARTEMEN
PENDIDIKAN dan berganti nama menjadi SMKN 3 BALEENDAH. Dan pada tahun 2003 pemerintah departemen pendidikan menarik
jurusan, yaitu Akuntansi dan Pemasaran, sejak
saat itu siswa harus membayar sekolah masing-masing dan tidak diberi uang oleh
sekolah. Tahun 2007 mulai di perbaiki setelah kepemimpinan Ibu Dra.Hj.Adah
Rodiyah,M.M.Pd. mulai di tingkatkan dengan dana 75jt dan menjadi sekolah
berwawasan lingkungan.